Transcriptomic approach to identify biomarkers for primary progressive multiple sclerosis in populations of dendritic cells

Abstract

[EN]Multiple sclerosis (MS) is an autoimmune disease of the central nervous system (CNS) characterized by inflammation and demyelination as well as axonal and neuronal degeneration. To date, effective therapies to reverse the disease are still lacking, so searching for biomarkers that could help distinguish the two mayor MS forms, relapsing-remitting (RRMS) and primary progressive (PPMS), is crucial. Increasing evidence indicates that dendritic cells (DCs) contribute to the pathogenesis of MS and might provide an avenue for therapeutic intervention. Therefore, in this study transcriptional profiling, in the basis of RNA-seq, of myeloid DCs (mDC) and plasmacytoid DCs (pDC) of 5 RRMS patients, 5 PPMS patients and 5 healthy controls was performed. Differentially Expressed Genes (DEG) analysis and Functional Enrichment Analysis demonstrated that there are many differences between the two multiple sclerosis forms in DCs. We were able to identify 20 genes that were differentially expressed between PPMS and RRMS patients in mDCs and > 100 in pDCs. Functional enrichment analysis also showed that the pathways identified as most significant were different in PPMS vs. RRMS between mDC and pDC.

[ES]La esclerosis múltiple (EM) es una enfermedad autoinmune del sistema nervioso central (SNC) caracterizada por inflamación y desmielinización, así como por degeneración axonal y neuronal. Hasta la fecha, todavía faltan terapias efectivas para revertir la enfermedad, por lo que es crucial buscar biomarcadores que puedan ayudar a distinguir las dos formas principales de EM, remitente-recurrente (EMRR) y progresiva primaria (EMPP). La creciente evidencia indica que las células dendríticas (CD) contribuyen a la patogénesis de la EM y podrían proporcionar una vía para la intervención terapéutica. Por lo tanto, en este estudio se realizó el perfil transcripcional, en base a RNA-seq, de CD mieloides (mCD) y CD plasmocitoides (pCD) de 5 pacientes con EMRR, 5 pacientes con EMPP y 5 controles sanos. Los análisis de expresión genética diferencial y el análisis de enriquecimiento funcional demostraron que existen muchas diferencias entre las dos formas de esclerosis múltiple en las CD. Pudimos identificar 20 genes que se expresaron diferencialmente entre pacientes con PPMS y RRMS en mCD y > 100 en pCD. El análisis de enriquecimiento funcional también mostró que las vías identificadas como más significativas eran diferentes en PPMS frente a RRMS entre mCD y pCD.